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microbiome傻傻分不清

2019年1月1日 - 微生物

Microbiota 微生物群

 

微生物群是指探讨动植物体上共生或病理的微生物生态群落。微生物群包括细菌、古菌、原生动物、真菌和病毒。探究讲明其在宿主的免疫、代谢和荷尔蒙等地方特别重大。近义词Microbiome微生物组即包括微生物,又包括其基因组

微生物, 

Metagenomics 宏基因组

 

宏基因是指直接琢磨环境样品作为遗传学材料。广义来説其包括条件基因组、生态基因组学和群体基因组学。传统的微生物学和微生物基因测序依赖于单克隆的塑造,早期环境基因测序克隆16s
rRNA基因等特定基因来规定自然样品中的生物多样性。此情势将会挂一漏万大量末被作育的微生物多样性。近来研讨选取鸟枪法或PCR直接测序方法来拿到样品群体中装有成员无偏好的基因。因为这类方法能够展现以前不可能察觉的微生物多样性,因而宏基因组方法提供了探索性的工具去精晓大家全部生活的世界。随着测序价格的降落,宏基因组允许微生物生态研究比此前更大的尺度和更多细节

 

Microbiome 微生物组

 

WiKi认为其与Microbiota同义,均为Microbiota词条。但骨子里这五个词分别还是很有些,看下图。

 

下边这篇Nature的Review,用图片的措施对这多少个词举办了定义和讲述,让我们来学习一下:

微生物 1

图1. 本综述中对微生物群、宏基因组和微生物组的定义。

每张图代表的是如出一辙的部落,可是不等的主意可以定义此群体可提供的不等音讯。

 

a. 微生物群:采取16S rRNA商讨方法鉴定此条件中微生物的花色。

b. 宏基因组:微生物群的基因和基因组,包括质粒、强调群体的遗传学潜能。

c. 微生物组:微生物群的基因和基因组,以及微生物群的产物与宿主环境。

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