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微生物宏基因组测序及分析

2019年4月13日 - 微生物

宏基因组测序:

  1. 浓度>=50ng/ul
  2. OD260/280:1.8-2.0
  3. DNA四遍必要量>=三ug

宏基因组测序需求提供什么样样品要求?

(一)提供环境微生物的基因组DNA大概扩大与增添产物,OD值在一.8~二.0
之间;样品浓度高于30
ng/ul;每回样品制备供给拾μg样品,要是急需反复筹备样品,则供给样品总量=制备样品次数*10
ug。

(贰)DNA样品请置于-20℃保存;请提供DNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称。请同时附上QC数据,包蕴电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检查评定数据。

(3)样品请置于一.5ml管中,管上注脚样品名称、浓度以及制备时间,管口使用Parafilm封口。建议使用干冰运输,并且尽量选择较快的邮寄格局,以减低运输过程中样品降解的或者性。

 

应用Solexa举行宏基因组测序,测序文库营造方式及质控什么?

答:采纳Solexa实行宏基因组
DNA测序,首先对一定条件微生物种群全基因组DNA实行领取。在领取微生物种群的DNA后制备DNA文库,具体步骤如下:

(1)将DNA随机打断成200-500bp的片段;

(贰)对DNA末端进行修复;

微生物,(三)将“A”碱基加入到DNA片段的叁’末端;

(四)在DNA片段的后面加上接头;

(伍)纯化连接产物;

(6)PC昂科威扩大与扩大连上接头的DNA片段;

(七)检查评定测序文库。

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